Væskekjølt, DOHC, 8-ventilert 649 cm3 Parallel Twin, med bensin-innsprøytning som villig, spesielt i nedre og midtre del av turtallskurven leverer kreftene smidig og med god respons. Motoren er oppsett med en ”kjørevennlig” karakteristikk effektmessig, noe som gir trygghet til "ferske" motorsykkelister.
Innsprøytning med nytt oppsett, har en bedre og jevnere respons (spesielt under 4,000 o/min.) og bidrar til den nye ER-6n`s gode gassrespons.
Motorens imponerende effekt-karakteristikk i mellomregisteret gjør sykkelen spesielt morsom under bykjøring, og det eksepsjonelle dreiemomentet forenkler forbikjøringer radikalt.
For ekstra krefter, smidig og sensitiv gassrespons har ER-6n 38 mm spjeldhus og ”sub-throttles”.
En bredere radiator (40 mm) gir bedre kjøleeffekt (17.4 kW >> 19.4 kW).}

Dobble 300 mm bølgeformede bremseskiver foran og 220 mm bremseskive bak, gir riklig med bremsekraft og den rette "look`en". I tillegg til de meget effektive skivebremsene, kan de som vil ha "litt ekstra" velge ABS –bremser som tilleggsutstyr. Frambremsehendelen er modifisert og har fått ny innfestning, noe som har bidratt til en jevnere og mer følsom frambrems. Både standard og ABS-modeller har nå en oppgradert frambrems, og har nå hovedsylinder med 14 mm stempel, og to-stemplede kalipere med 27 mm stempel. Oppgradering av hovedsylinder og kalipere er spesielt merkbart på modeller med ABS-bremser.

Sittestillingen er spesielt utviklet med tanke på komfort og kontroll. Et ideelt samspill mellom styre, sete og fothvilere tilbyr en komfortabel og naturlig sittestilling som vil falle i smak for de fleste motorsyklister. Den smale rammen og den slanke motoren gjør dette til en slank konstruksjon totalt, og tillater fører/passasjer å holde knær og bein nærmere hverandre. Takket være den lave sittehøyden og den slanke konstruksjonen, er det enkelt å nå bakken med begge beina når man står stille eller må stoppe, noe som er viktig for mange motorsykkelførere. Håndtakene til passajer (tidligere i plast, nå i aluminium) har fått nytt design og en lavere plassering, noe som øker komforten, og gjør det enklere for passasjeren å holde seg fast.

Sett bakfra eller fra siden, er det "skarpe" designet på setet og hekk meget tydlig. Den nye baklykten med LED og blinklysene er med å forsterke dette inntrykket.